Aurinkopaneelin hinta muodostuu sen koosta, materiaalista ja tehosta. Aiemmin todettiin, että yksikiteisestä piistä valmistettu aurinkopaneeli on tehokkaampi kuin monikiteisestä valmistettu. Toisaalta yksikiteisen piin käyttäminen aurinkopaneelissa on kalliimpaa kuin monikiteisen. Myös uudemman tekniikan ohutkalvo-aurinkopaneeleita saa halvalla, mutta näiden tehokkuus on heikompi kuin piivalmisteisissa. Aurinkopaneelien hintoja vertaillessa kannattaakin ensisijaisesti katsoa tehon ja hinnan suhdetta (euroa/watti).
Aurinkopaneelien hinnat olivat ainakin alkuun varsin korkeita, mutta käytön lisääntymisen, kilpailun voimistumisen ja tekniikan kehittymisen myötä niiden hinnat ovat alkaneet laskemaan. Nykyään pienitehoisia aurinkopaneeleita saa Suomessa alle 200 eurolla. Aurinkopaneelien tehon tarpeesta riippuen niihin voi toisaalta kuluttaa useita tuhansia euroja. Hintaan vaikuttaa oleellisesti myös aurinkopaneelien mukana myytävät oheislaitteet.